Здравствуйте! Спасибо за очень интересный вопрос!!!
Мне нравится сценарий работы, предложенный вами, но конечно, все зависит от объемов вашей продукции, если у вас больше 1000 производимых номенклатурных позиций, то "плодить" номенклатуру и выбирать нужный элемент во всей производственной цепочке, будет сложно (при ограниченных людских ресурсах в бухгалтерии).
На форуме 1С, есть ветка обсуждений с таким же учетом
partners.v8.1c.ru/forum/message/1832339#m_1832339
специалисты убеждают, что можно не плодить номенклатуру, а использоваться один элемент, в документе "Поступление из переработки" и в закладке продукция и использованные материалы, т.е. не создавать второй элемент КОРПУС ИЗДЕЛИЯ С ПОКРАСКИ, а использовать тот, который и передали. При этом важно, чтобы получить корректную оценку стоимости этой позиции, должен быть включен суммовой учет по складам.
Разносить услуги переработки документом "Поступление (акт, накладная)", считаю не правильно, т.к. теряются данные оперативного учета (т.е. в момент времени непонятно, где тот или иной полуфабрикат, условно по программе числится на складе, а по факту у переработчика). Но опять, же если у вас производство оперативно отражает эти данные в другой программе (например, УНФ, КА и т.д.), а вы только считаете себестоимость и сдаете регламентированные отчеты из 1С:Бухгалтерии, то тогда такой вариант будет приемлемым.