Здравствуйте, даже если уже период прошел, мне надо за январь подать,,

Дополняющая форма существует для исправления ошибок в любых периодах в пределах срока исковой давности.

Здравствуйте,созвонилась я со своим ПФ ,где мне сказали ,что за дополнительные сведения штраф-500 р.за каждого человека,,

В любом случае Вам необходимо подать доп сведения.
Чтобы попытаться избежать штрафа, проведите это начисление в текущем месяце. Но в данном случае месяц начисления не будет соответствовать акту. При проверке это может выясниться.

Чтобы частично избежать штрафных санкций, переделайте документы. В договоре пропишите предоплату, если оплата была в прошлых месяцах, акт сделайте текущим месяцем. С предоплаты не нужно платить страховые взносы. А вот срок уплаты НДФЛ - день, следующий за выплатой дохода.