Сотруднику с 03.09 по 30.09 был оформлен отпуск, который был начислен и выплачен в 28.08.2018г, 01.10.2018г сотрудник приносит больничный лист с 20.09 по 28.09 и пишет заявление на продление отпуска до 09.10.2018г, как правильно оформить в ЗУП 8.3.

Добрый день!
По вашему вопросу есть полное описание в статье "Продление отпуска в связи с болезнью" на ресурсе ИТС: its.1c.ru/db/staff1c#content:33877:zup30...83%D1%81%D0%BA%D0%B0
Если нет полной подписки можно оформить ДЕМО-версию на 7 дней.

К сожалению демо доступ был уже использован, а второй раз нельзя оформить.

Последовательность действий в программе следующая:
1) Вводите документ "Больничный лист", в этом документе в закладке "Перерасчет прошлого периода" будут сторнированы суммы начисленного за этот период отпуска, в закладке "Начислено" будет рассчитана сумма за счет работодателя, и за счёт ФСС, если ваш регион подключен к пилотному проекту, то будут только дни без сумм.
2) Для продления отпуска, необходимо зайти в первоначальный документ "Отпуск" и по ссылке "Исправить" изменить в исправляемом документе только дату окончания отпуска, увеличив ее на количество дней, совпавших с периодом временной нетрудоспособности, в этом случае средний заработок для оплаты продления отпуска будет такой же, как и для оплаты основной части отпуска.