Добрый день. Подскажите как правильно отразить возврат денег с депозитного счета в 1С? Они должны пройти через прочие поступления Кт 55.03, а в счете плательщика надо указать № р/с депозита?

Здравствуйте!
Если Вы работаете в 1С: Бухгалтерии предприятия, то да, это будет вид операции "Прочее поступление", счет Кт 55.03 и счет депозита нужно обязательно указать в качестве субконто. Поле "Счет плательщика" можно не заполнять.
А если в 1С: Комплексная автоматизация или 1С: УПП, то там есть специальный вид операции в платежном поручении - "Перевод на другой счет".