У нас в ноябре увеличили всем оклады. Я в кадровых перемещениях вручную всех занесла с новыми окладами. Но в расчете З/п программа часть людей выдает с новыми окладами, часть с прежними. Я уже заходила в "сотрудники", там меняла цифры на новые и в принятии на раб. Программа все равно часть поменяла, часть нет. ЗУП 2,5

Попробуйте для тех сотрудников, по кому не получилось изменить оклады, воспользоваться способом, описанным в статье учетбеззабот.рф/raschet-zarabotnoj-platy...t-razmer-oklada-v-1s
Менять в приеме на работу я бы не рекомендовала, всё-таки в программе должна храниться вся история окладов и старые значения тоже могут пригодиться, например, при перерасчетах за прошлые периоды.
А вообще в таком случае, когда всё делали одинаково, но по кому-то получилось, а по кому-то нет, нужно смотреть базу. Иначе сложно что-то посоветовать, не видя ситуацию в целом, причин может быть множество.