Сотруднику организации, кроме зарплаты еще выплачиваются денежные средства за аренду автомобиля документом "Регистрация разовых начислений и удержаний". Заведено начисление "Аренда автомобиля" (код дохода 2400). Аренда за сентябрь, начисляется в сентябре (дата документа 30.09.2016), а выплачивается в октябре (5.10.2016).В документе "Регистрация разовых начислений и удержаний" есть дата выплаты дохода для НДФЛ, мы проставляем дату 05.10.2016 и тогда на вкладке НДФЛ автоматически встает дата получения дохода 05.10.2016. В итоге получается, что в 6-НДФЛ за 3 квартал 2016 года в 1 раздел сумма НДФЛ не встает в ячейку 040. Хотя по отчету "Анализ начисленных налогов и взносов" данная сумма исчисленного налога есть именно в сентябре. Почему в 1 разделе 6-НДФЛ за 3 кв. нет суммы, исчисленного налога и дохода, который исчислен в сентябре, но выплачен в октябре?

Здравствуйте!
Это правильное поведение программы, датой получения дохода за аренду автомобиля будет являться дата выплаты, т.е. в 6-ндфл будут следующие даты:
05.10.2016 - дата получения дохода
05.10.2016 - дата удержания налога
06.10.2016 - срок перечисления налога
Все даты относятся к 4 кварталу, поэтому нет основания для включения этой информации в отчет 6-НДФЛ за 3 квартал.
Дата документа начисления и указанный в нем период в данном случае значения не имеют, расхождения данных 6-НДФЛ с отчетом "Анализ начисленных налогов и взносов" бывают достаточно часто и такие ситуации вполне обоснованы.

Спасибо большое!