В какую налоговую нужно уплатить организации Упрощенный налог (Доходы - расходы)по обособленному подразделению, если обособленное подразделение не является филиалом и не имеет отдельного баланса? И как должны оформляться документы на реализацию по такому обособленному подразделению?

Здравствуйте.
В случае создания филиала организация не вправе применять УСН. Об этом напоминает Минфин в письме от 06.03.2017 № 03-11-11/12586. Обособленные подразделения иного вида, в том числе представительства, препятствием к применению спецрежима не являются.
Если Ваше обособленное подразделение не относится к филиалам, тогда Вы вправе применять УСН.
Наличие или отсутствие у организации обособленных подразделений не влияет на порядок ведения учета. Отчетность по УСН (КУДИР, декларация) ведется головным отделением, отдельно формировать отчетность по доходам обособленных подразделений не нужно. Подавать налоговую декларацию, а также платить налог и авансовые платежи по налогу необходимо по месту регистрации главной организации.