Здравствуйте! ЗУП 3.1. Справка 2-ндфл для сотрудника - поле Удержано из какого документа программа берет данные? сумма в поле Удержано меньше, чем в поле Исчислено. Если по месяцам смотрю начисление зп - каждый месяц ндфл удержан. Переход с зуп 2.5. на 3.1. был на 01.06.2018 - может с этим связано?
Сумма в поле Перечислено меньше, чем Исчислено/Удержано - это в ведомости в банк не заполнено графа НДФЛ?

Добрый день!
В 1С:ЗУП 3.1 удержание НДФЛ производится при помощи документа "Ведомость на выплату зарплаты в кассу/банк/на счета", должна быть заполнена графа табличной части по сотрудникам "НДФЛ к перечислению". Для анализа состояния учета НДФЛ в программе можно воспользоваться отчетом "Анализ НДФЛ по месяцам", закладка "Налоги и взносы" - "Отчеты по налогам и взносам"
Для полного понимания учета по НДФЛ рекомендую наш вебинар: "6-НДФЛ:с азов на практических примерах в 1С", который можно заказать 1c-bezzabot.ru/