1) Какие налоги и отчисления нужно платить компании за оплату труда резидентам РФ, работающим по трудовому договору?

2) Какие налоги и отчисления нужно платить компании за оплату труда резидентам РФ, работающим по гражданско-правовому договору?

3) Надо ли компании оплачивать больничный лист резиденту, работающему по гражданско-правовому договору, вне зависимости предъявляет он этот больничный лист или нет?

Здравствуйте!
Про налоги и взносы, которые платятся с заработной платы можно почитать в статье:
www.buhsoft.ru/article/4315-vse-nalogi-s...otsentah-v-2023-godu
многое зависит, от того какой вид деятельности у организации, являющейся работодателем.
По договору ГПХ, в общем случае, платятся те же самые налоги, кроме страховых взносов на социальное страхование и травматизм (но и тут есть нюансы), про ГПХ можно почитать тут:
secrets.tinkoff.ru/bezopasnost-biznesa/nalogi-vznosy-gph/
С 2022 года больничный лист работодатель получает по электронным каналам связи с ФСС. О том, кто имеет право на оплату больничного листа с 2023 года, подробнее в статье:
www.klerk.ru/buh/news/534722/#:~:text=%D...87%D0%BD%D1%8B%D1%85.