Дано: с осужденного сотрудника нужно удержать 10% в доход государства и 50 процентов алиментов.
Пример удержания: 50000*10%= 5000 в доход государства
50000*13%= 6500 НДФЛ
50000-6500-5000=38500/2= 19250 алименты
Вопрос: как настроить 1С таким образом, что бы алименты удерживались за вычетом НДФЛ и суммы 10% в доход государства согласно п.1 статьи 100 №229-ФЗ

Здравствуйте, в какой программе ведёте учет (ЗУП, БП, КА, УПП)? Про удержание алиментов можно почитать в статье:

учетбеззабот.рф/mobile-rasch-zp/main/ras...mmnykh-produktakh-1s

Удержание в доход государства можно сделать только в зарплатных подсистемах 1С, пример:

учетбеззабот.рф/mobile-rasch-zp/main/ras...nalom-redaktciia-3-1

Учет ведется в ЗУП
Статья 2020 года, на сегодня там устаревшая информация. Нужно при расчете удержаний по алиментам и кредитам из суммы заработной платы вычитать НДФЛ и удержание с осужденного, а только потом считать саму сумму удержания (статья 100 №229 ФЗ "Об исполнительном производстве"

Расчет исходя из вашей статьи: из общей суммы заработной платы должна вычитаться и сумма удержания в доход государства. Исходя из Вашего примера должно быть 50000-5000-6500=38500/3=12833 нужно удержать, а не 14500

если нужно удерживать НДФЛ, то все сделать через исполнительные листы.