Здравствуйте!
В книгу учета доходов и расходов УСН 15% затраты по зарплате и зарплатным налогам попадают «частями», для признания данных расходов, нужно чтобы выполнялось два условия: зарплата и взносы должны быть начислены и переведены по банку. Например, в январе выгружаете документ «Отражение зарплаты в бухучете» (или делаете в бухгалтерии документ «Начисление зарплаты»), а до 10 февраля платите зарплату и взносы, то в КУДиР затраты попадут в феврале, в размере переведенных по банку сумм.
В вашем случае, для начала стоит сформировать отчет в меню «Отчеты» - «Анализ учета по УСН», обратить внимание на блок «Налоги, взносы, НДФЛ» (для расшифровки суммы нужно два раза щелкнуть по данному блоку), далее проанализировать колонки «Начислено», «Выплачено», «Принято к расходам». Возможно на начало 2020 года был некорректный остаток (колонки «Начальная задолженность»), для его исправления нужно сделать документ «Операция, введенная вручную», по кнопке «Еще» выбрать «Выбор регистров» поставить флаг «Расходы при УСН» - «ОК». После внести в табличную часть «Расходы при УСН» сторнирующую запись неверной суммы. Например, если горит задолженность по счету 69.01, которой фактически на начало года нет, то нужно внести строку «Расход», вид расхода «Налоги, взносы», счет учета «69.01», отражение в НУ и сумму. Для корректного заполнения всех граф регистра, лучше найти неверную запись в самом регистре и сделать такую же, но с противоположным видом движения.