Здравствуйте! В этой ситуации можно поступить следующим образом:
1) Завести контрагента - головное подразделение, в справочнике "Контрагенты" вид контрагента "Юридическое лицо", провести от него оплату, документ "Списание с расчетного счета", получим проводку ДТ 60.02 - КТ 51
2) Завести контрагента - обособленное подразделение, в справочнике "Контрагенты" вид контрагента "Обособленное подразделение" в поле "Головной контрагент" указать элемент из п.1, провести от него поступление, документ "Поступление (акт, накладная)", получим проводку ДТ 26,20,10,41 ( в зависимости от операции, услуга это или ТМЦ) - КТ 60.01
3) при помощи документа "Корректировка долга" сделать взаимозачет. Подробно об этом говорили в статье:
учетбеззабот.рф/mobile-buch/main/bukhgal...erii-predpriiatiia-8
В этом варианте, если у данного контрагента вы будете работать с несколькими обособками, а оплата будет идти на головное подразделение, всегда будет видно за какую обособку и когда вы платили, также корректные ИНН/КПП будут вставать в раздел 8 декларации по НДС из документов поступления.
Если же у данного поставщика всего одна обособка, вы не плательщик НДС, то поступление можно завести на головное подразделение.
