Все, теперь ситуация прояснилась, спасибо за подробное объяснение!
Но Ваш вариант учета мне не кажется верным, в ФНС Вам сказали, что эту сумму нужно отразить как излишне удержанную? Вы эту сумму вернули сотруднику, по итогам налогового периода излишнего удержания нет. Я согласна, что эта сумма должна быть отражена по строке 090 в 6-НДФЛ и в справке 2-НДФЛ как сумма налога перечисленная (и по факту у вас возникает переплата по налогу). Но вот излишнее удержание не совсем понимаю в этой ситуации.
Что касается отражения в 1С: ЗУП, то тут есть один неприятный момент (привожу Вам цитату ответа разработчиков):
"Автоматический зачет авансов по доходам предыдущих месяцев не поддерживается, на сегодня это известная особенность поведения.
Авансы засчитываются только при очередных начислениях налога.
Т.е. введенный в июле авансовый платеж "сам собой" учтется в первом же июльском расчете налога, но регистрации налога прошлых периодов к возврату не будет.
Поэтому, если сумма аванса велика и его не зачесть до конца года, имеет смысл пересчитать налог этого человека в документах-начислениях предыдущего месяца."
То есть они советуют сначала пересчитать НДФЛ по данному сотруднику в старых документах начисления зарплаты (с апреля в Вашем случае), а уже затем эти суммы попадают автоматически в документ возврата НДФЛ и корректно отражаются по регистрам. При этом никакого излишне удержанного налога не будет в справке.
НО этот вариант плох тем, что при его реализации изменяются показатели 6-НДФЛ, поэтому момент достаточно спорный.
На мой взгляд, в справке 2-НДФЛ должно быть:
налог исчисленный 15717р,
сумма фиксированных авансовых платежей 15717р
сумма налога удержанная 0р (весь налог вернули сотруднику, удержания по итогу года нет),
сумма налога перечисленная 5070р (возникла переплата),
сумма налога излишне удержанная 0р (излишнего удержания тоже нет)