Здравствуйте.
Поскольку применили коэффициент больший, сумма компенсации за неиспользованный отпуск получилась меньше, чем необходимо.
Если Вы уплачиваете налог с доходов (выручка минус расходы), то налог Вы не занизили. К тому же налоговый орган не проверят правильность таких расчетов. По страховым взносам и НДФЛ такая же ситуация. Риска выявления нарушения нет.
Теоретически проблема может возникнуть только в том случае, если уволенные сотрудники пожалуются на Вас в трудовую инспекцию. Тогда Вам придется сделать перерасчет, доплатить людям. В этом случае трудовая инспекция выпишет административный штраф. О сумме сказать не могу, так как они применяют разные виды штрафов: на виновное лицо или на организацию. Выбор за трудовой инспекцией. Вероятность возникновения такой ситуации минимальна. Я даже не встречала такого.
В Вашей ситуации я бы ничего делать не стала. Оставьте всё, как есть. Не привлекайте к себе внимание.